首先，如果一个或数个口腔溃疡反复发作甚至此起彼伏，疼痛难忍或伴有其他部位的溃疡，则更要引起高度重视，因为这种复发性溃疡很可能是一种免疫病-白塞氏病的警示信号。
其次，系统性红斑狼疮也可以导致口腔溃疡的反复发作。
最后，长期经久不愈的口腔溃疡也要当心癌变的可能。如果溃疡直径达1厘米以上，边缘隆起、不整齐，中央凹陷，凹陷的表面有颗粒状的小疙瘩，在溃疡的周围和底部可摸到硬块，就可能是癌变的迹象。而对于口腔内经久不愈的溃疡，由于经常受到咀嚼、说话的刺激，日久可能会发生癌变。若是同一处口腔溃疡，伤口超过三周以上仍未改善，就要警惕是否为发生口腔癌的信号。除了口腔有溃烂，如果发现舌、颊、牙齿等部位出现不明原因的疼痛，嘴巴里面有肿块，且用常规手段久治不愈时，都应该及时到正规医院颌面外科检查。
此外，口腔是人体抵御外界病菌入侵的第一道关卡，是咽喉要道的前哨。口腔溃疡发作后，如果溃疡处没有很快愈合，各种细菌病毒就可能通过患处蔓延到咽部引发急性咽喉炎、牙龈炎等一系列口咽部疾病。
