白癜风患者与正常人相比，患自身免疫病的几率要大很多，白癜风会影响免疫系统，这点对研究治疗白癜风有很重要的意义。
白癜风患者常发生其他自身免疫病，如甲状腺功能亢进、甲状腺炎、糖尿病、恶性贫血、addison病、斑秃、晕痣、溃疡性结肠炎、系统性红斑狼疮、硬皮病等，但有学者经统计分析认为均与甲状腺疾病有关。白癜风病人存在着细胞免疫及体液免疫异常，不同实验证实白癜风皮损中cd3+、cd4+、cd8+t细胞显著增加，而外周血th细胞减少，ts细胞增加。患者血清中可测到多种自身抗体。国外有报告一半以上病人血中可测到一种以上自身抗体。如抗甲状腺抗体、抗胃壁细胞抗体及抗核抗体等。但最直接的证据是抗黑素细胞的循环抗体。患者血清中可测到特异性抗黑素细胞抗体，阳性率达50%~93%，且其滴度与病情相关。其作用为通过补体激活抗体依赖的细胞毒反应（adcc）。皮质类固醇激素治疗有效的原理是抑制ascc。
