由于该病症状表现十分复杂，所以诊断相对困难，尤其有些症状和慢性膀胱炎等很相像，故误诊概率极高。
有很多人误以为间质性膀胱炎是细菌引起的膀胱发炎，或以为是膀胱表皮急性发炎。其实这些都不是诱发原因。一般认为，其诱因是膀胱上皮下方的间质（细胞与细胞之间连接的组织）慢性发炎，发炎细胞之中最重要的就是纤维母细胞，因为慢性发炎导致纤维化，才引发症状。
虽然至今该病病因仍没最后确定，但治疗方法较多。
目前最新的治疗方法包括
口服药物治疗
膀胱加水扩张术，膀胱内药物清洗
激光烧灼手术
膀胱剥离扩大手术
生物回馈法或神经电刺激术（训练骨盆腔肌肉群）
